Культ Аполлона на побережье Чёрного моря (древнего Эвксинского Понта) начал распространяться с середины VII века до нашей эры вместе с первыми греческими переселенцами из ионийских городов Малой Азии. Хотя прямых свидетельств в виде древних оракулов об основании этих колоний почти не сохранилось, считается, что благословение на их создание давалось через знаменитое святилище Аполлона в Дидимах близ Милета — метрополии большинства черноморских колоний.
Согласно мифологии, Аполлон — сын Зевса и Лето, брат-близнец Артемиды. Происхождение его культа до конца не ясно: он, вероятно, пришёл в Грецию с севера или из Малой Азии. Интересно, что в «Илиаде» Гомера Аполлон выступает на стороне троянцев против греков, что может указывать на его изначально негреческие корни. В контексте Причерноморья особое значение приобретает его эпитет «Гиперборейский», связывающий бога с таинственным народом, жившим, по представлениям древних, далеко на севере, у Рипейских (Уральских?) гор.
Культ Аполлона был чрезвычайно распространён по всему побережью Чёрного моря. Это неудивительно, поскольку большинство колоний основали выходцы из Милета, для которых Аполлон Дидимский был покровителем. Колонисты, отправляясь в опасное плавание к неизвестным берегам, обязательно испрашивали его волю и защиту. В честь бога даже был назван город — Аполлония Понтийская (на территории современной Болгарии). Согласно источникам, в нём с момента основания стоял величественный храм со знаменитой бронзовой статуей работы афинского мастера Каламиса, позже вывезенной римлянами в качестве трофея.
Одним из важнейших центров почитания Аполлона была колония Истрия в устье Дуная, основанная милетцами также в VII веке до н.э. Археологические и эпиграфические данные свидетельствуют, что здесь, особенно в первые века существования города, доминировал культ Аполлона Врача (Иатра). В городе, вероятно, было как минимум два храма, посвящённых этому богу.
Культ был популярен и в других западнопонтийских городах — Томис, Одессос, а также в основанных мегарцами Месембрии и Каллатисе. Но особенно сильные позиции он занимал на северном побережье, в колониях, основанных или контролируемых Милетом: в Ольвии, Пантикапее (столице Боспорского царства), Феодосии. В Ольвии археологи обнаружили два древних святилища — одно, посвящённое Аполлону Врачу, было построено сразу при основании города, а позже рядом появилось святилище Аполлона Дельфиния. В Пантикапее же на акрополе в V веке до н.э. был возведён великолепный ионический храм Аполлона Врача, символизировавший союз греческих городов Боспора.
Таким образом, Аполлон в различных своих ипостасях — как пророческий бог-покровитель колонистов, как целитель и как гиперборейское божество — стал одной из центральных фигур религиозной жизни греческих полисов Чёрного моря, а его культ служил важным связующим звеном между колониями и их метрополией.